Arhivska zbirka je posebna cjelina, važna za povijest Dalmacije, unutar koje su ostavštine don F. Bulića, M.Abramića, L. Jelića, F. Carrare, J. Bajamontija i obitelji Pavlović-Lučić. Arheološki muzej je 1878. g. započeo izdavati prvi arheološki časopis u Hrvatskoj Bullettino di archeologia e storia dalmata, koji od 1920. g. izlazi pod hrvatskim nazivom Vjesnik za arheologiju i historiju dalmatinsku.